Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms