Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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ZNF548Q8NEK5 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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ZNF548Q8NEK5 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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ZNF548Q8NEK5 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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ZNF548Q8NEK5 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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ZNF548Q8NEK5 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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ZNF548Q8NEK5 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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