Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CLIP4Q8N3C7 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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CLIP4Q8N3C7 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CLIP4Q8N3C7 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CLIP4Q8N3C7 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CLIP4Q8N3C7 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CLIP4Q8N3C7 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CLIP4Q8N3C7 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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