Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms