Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
AP5B1Q2VPB7 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms