Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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