Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 SLC7A2-202ENST00000398090 7557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 TBC1D30-204ENST00000542120 7433 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 ZNF226-213ENST00000588883 5972 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 PCDH19-201ENST00000255531 7937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 PCDH19-203ENST00000420881 7936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 DDX52-213ENST00000617633 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 HIVEP3-201ENST00000372583 12193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 SLMAP-203ENST00000383718 6749 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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