Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.6 ms