Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC009269.1-203ENST00000496414 828 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC025188.1-201ENST00000507514 600 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms