Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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VPS72Q15906 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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VPS72Q15906 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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VPS72Q15906 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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VPS72Q15906 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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VPS72Q15906 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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VPS72Q15906 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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VPS72Q15906 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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