Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC244196.5-201ENST00000617347 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 KCNJ10-204ENST00000637644 1239 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
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VAMP3Q15836 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 NUDT5-202ENST00000378937 919 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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VAMP3Q15836 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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VAMP3Q15836 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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VAMP3Q15836 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
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VAMP3Q15836 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC124944.3-204ENST00000641191 150 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
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