Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SYCP1Q15431 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms