Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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