| RUNX3 | Q13761 | AC021876.1-201 | ENST00000425959 | 359 nt | BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CLEC12A-205 | ENST00000434319 | 1515 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VN1R96P-201 | ENST00000446052 | 858 nt | BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL5P16-201 | ENST00000471467 | 790 nt | BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MRPS33-209 | ENST00000496958 | 688 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | USP26-203 | ENST00000511190 | 3665 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC098976.1-201 | ENST00000513014 | 541 nt | BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP276-201 | ENST00000516242 | 268 nt | BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZFAND1-208 | ENST00000519523 | 698 nt | TSL 2 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012339.2-201 | ENST00000523996 | 453 nt | BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00687-203 | ENST00000558175 | 696 nt | TSL 3 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009137.2-201 | ENST00000568179 | 641 nt | TSL 3 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007599.2-201 | ENST00000573040 | 493 nt | TSL 5 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC016745.2-201 | ENST00000608834 | 3443 nt | BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NKIRAS1-209 | ENST00000614374 | 1612 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC243654.3-201 | ENST00000617427 | 735 nt | TSL 5 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL442128.2-201 | ENST00000620246 | 1824 nt | BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012414.7-202 | ENST00000622705 | 1090 nt | BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC002044.3-201 | ENST00000623314 | 541 nt | BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL138828.1-201 | ENST00000626414 | 291 nt | TSL 5 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00550-201 | ENST00000629293 | 3434 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SPTY2D1-AS1-204 | ENST00000634992 | 373 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ACADSB-201 | ENST00000358776 | 5859 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PIGK-203 | ENST00000445065 | 4318 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CEP295-206 | ENST00000531700 | 2890 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ERVH48-1-201 | ENST00000447535 | 2790 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01378-201 | ENST00000422145 | 2516 nt | TSL 3 BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MYNN-203 | ENST00000544106 | 4815 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF415-201 | ENST00000243643 | 2270 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02085-201 | ENST00000465215 | 2051 nt | TSL 2 BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SV2B-201 | ENST00000330276 | 11202 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DNAH8-201 | ENST00000327475 | 14360 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SMARCA2-206 | ENST00000382185 | 1584 nt | TSL 2 BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL603962.1-201 | ENST00000413148 | 436 nt | TSL 5 BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018832.1-201 | ENST00000428171 | 566 nt | TSL 4 BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC016712.1-201 | ENST00000431088 | 378 nt | BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NRBF2P3-201 | ENST00000432731 | 865 nt | BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NAP1L4P3-201 | ENST00000432820 | 1147 nt | BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL359265.2-201 | ENST00000434367 | 631 nt | BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC234781.3-201 | ENST00000452540 | 973 nt | BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC017101.1-201 | ENST00000453665 | 571 nt | TSL 4 BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL445524.1-204 | ENST00000454631 | 458 nt | TSL 3 BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CXorf51A-201 | ENST00000458472 | 431 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SSR3-206 | ENST00000476217 | 807 nt | TSL 3 BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012123.2-201 | ENST00000485809 | 248 nt | BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093267.1-201 | ENST00000489176 | 961 nt | BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C1orf143-202 | ENST00000491260 | 813 nt | TSL 3 BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL441P-201 | ENST00000492388 | 296 nt | BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093720.1-201 | ENST00000505681 | 714 nt | BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC024587.2-201 | ENST00000509458 | 805 nt | TSL 3 BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC020551.1-201 | ENST00000512036 | 539 nt | TSL 3 BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC097460.1-204 | ENST00000515026 | 764 nt | TSL 5 BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC084033.1-201 | ENST00000550830 | 633 nt | BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | WDR61-205 | ENST00000558459 | 884 nt | TSL 3 BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OOSP1P2-201 | ENST00000579644 | 351 nt | BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01676-204 | ENST00000595309 | 871 nt | TSL 5 BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ELAVL2-202 | ENST00000380110 | 3691 nt | TSL 5 BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RYR3-201 | ENST00000389232 | 15552 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MECOM-202 | ENST00000433243 | 3508 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KCNMB2-210 | ENST00000617329 | 2214 nt | TSL 2 BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR2AT4-202 | ENST00000641504 | 8661 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SCN1A-218 | ENST00000640036 | 8131 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ERVFRD-3-201 | ENST00000578561 | 1617 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EIF3H-209 | ENST00000521861 | 3959 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ECM1P2-201 | ENST00000503354 | 1577 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC1A3-202 | ENST00000381918 | 3652 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CSPP1-201 | ENST00000262210 | 4367 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ADGRL2-222 | ENST00000627151 | 5789 nt | TSL 5 BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PRR4-201 | ENST00000228811 | 563 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL035079.1-201 | ENST00000405210 | 287 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL121885.1-201 | ENST00000417957 | 451 nt | TSL 3 BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DPPA2P2-201 | ENST00000418220 | 897 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | COX6CP17-201 | ENST00000421389 | 185 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EIF2S2P3-201 | ENST00000428356 | 999 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C4BPAP2-201 | ENST00000428434 | 478 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM237A-201 | ENST00000441223 | 773 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01133-202 | ENST00000443364 | 1266 nt | TSL 5 BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC034228.3-201 | ENST00000446275 | 562 nt | TSL 3 BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC068707.1-201 | ENST00000451438 | 391 nt | TSL 3 BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGB1P4-201 | ENST00000455362 | 567 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL23AP56-201 | ENST00000460778 | 453 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010326.1-201 | ENST00000462726 | 602 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KRTAP5-14P-201 | ENST00000502328 | 121 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008574.1-201 | ENST00000514240 | 433 nt | TSL 3 BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087855.1-201 | ENST00000518178 | 430 nt | TSL 3 BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C1GALT1P3-201 | ENST00000522049 | 819 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SOX5P1-201 | ENST00000524155 | 1127 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC084880.2-201 | ENST00000536009 | 501 nt | TSL 3 BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PRR4-206 | ENST00000540107 | 388 nt | APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NDUFB4P11-201 | ENST00000560510 | 395 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PWRN1-206 | ENST00000565512 | 433 nt | TSL 2 BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BCAR4-204 | ENST00000573319 | 1273 nt | TSL 5 BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTATP6P25-201 | ENST00000574491 | 261 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000919.3-201 | ENST00000582591 | 568 nt | TSL 3 BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC068790.7-201 | ENST00000602347 | 528 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02340-201 | ENST00000610335 | 626 nt | TSL 3 BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC019206.1-201 | ENST00000621938 | 425 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CR381572.2-201 | ENST00000624852 | 397 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR2M2-202 | ENST00000641211 | 1229 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR2M2-203 | ENST00000641836 | 1151 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |