Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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