Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LMAN2Q12907 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms