Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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