Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.5 ms