Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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