Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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PTPRCP08575 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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PTPRCP08575 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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PTPRCP08575 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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PTPRCP08575 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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PTPRCP08575 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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PTPRCP08575 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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PTPRCP08575 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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PTPRCP08575 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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PTPRCP08575 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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