Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
FANCFQ9NPI8 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms