Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms