Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms