Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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ZNF548Q8NEK5 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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