Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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CCDC142Q17RM4 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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CCDC142Q17RM4 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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CCDC142Q17RM4 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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CCDC142Q17RM4 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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CCDC142Q17RM4 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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