Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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RTL8BQ17RB0 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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RTL8BQ17RB0 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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RTL8BQ17RB0 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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RTL8BQ17RB0 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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RTL8BQ17RB0 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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RTL8BQ17RB0 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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RTL8BQ17RB0 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RTL8BQ17RB0 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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