Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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VPS72Q15906 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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VPS72Q15906 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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VPS72Q15906 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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VPS72Q15906 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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VPS72Q15906 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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