Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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