Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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CHD4Q14839 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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CHD4Q14839 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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CHD4Q14839 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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CHD4Q14839 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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CHD4Q14839 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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CHD4Q14839 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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CHD4Q14839 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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CHD4Q14839 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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CHD4Q14839 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHD4Q14839 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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