Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms