Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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