Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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TCIRG1Q13488 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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TCIRG1Q13488 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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TCIRG1Q13488 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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TCIRG1Q13488 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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