Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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SP140Q13342 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SP140Q13342 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SP140Q13342 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SP140Q13342 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SP140Q13342 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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SP140Q13342 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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SP140Q13342 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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SP140Q13342 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SP140Q13342 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SP140Q13342 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SP140Q13342 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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SP140Q13342 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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SP140Q13342 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SP140Q13342 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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SP140Q13342 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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SP140Q13342 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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SP140Q13342 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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SP140Q13342 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SP140Q13342 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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