Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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