Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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