Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms