Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 ARNTL2-207ENST00000542388 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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PTPRMP28827 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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PTPRMP28827 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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PTPRMP28827 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 IL22RA2-203ENST00000349184 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
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