Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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HOXD10P28358 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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HOXD10P28358 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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HOXD10P28358 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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HOXD10P28358 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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HOXD10P28358 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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HOXD10P28358 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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HOXD10P28358 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
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HOXD10P28358 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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HOXD10P28358 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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HOXD10P28358 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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HOXD10P28358 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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HOXD10P28358 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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HOXD10P28358 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD10P28358 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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