Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MAP3K4Q9Y6R4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms