Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NCOA3Q9Y6Q9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms