Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms