Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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