Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXI6

RNF186, RING finger protein 186, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF186Q9NXI6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF186Q9NXI6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF186Q9NXI6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms