Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ARFGAP3Q9NP61 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFGAP3Q9NP61 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms