Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTPRHQ9HD43 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms