Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC52A2Q9HAB3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC52A2Q9HAB3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms