Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF8Q9BRL6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms