Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FYCO1Q9BQS8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms