Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN18Q99952 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms