Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPK3Q96L96 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms